人體腸道是一個複雜的菌群微生態環境，包容80％以上寄生於人體的微生物。根據腸道菌群對宿主健康的影響可將其分為有益菌群和有害菌群。微生態學認為，當人體腸道內棲息的有益菌群在數量上佔優勢時，有利於人體保持健康。通常情況下，健康人腸道菌群的組成相對穩定，但也隨著季節、年齡、飲食、疾病、用藥和個體差異等因素而有所不同。在某些因素的影響下，機體正常微生物群之間及組成正常微生物群的微生物之間的平衡被破壞所引起的病理狀態稱為微生物失衡，包括菌群失調和細菌易位。前者指腸道原籍菌群數量下降，潛在致病菌大量生長，後者指由於腸道通透性改變導致腸道菌群透過腸黏膜到達區域性系膜淋巴結或更遠組織。引起微生物失衡的因素主要包括宿主和微生態環境兩方面的因素。宿主因素包括機體對環境不適應、患病和治療措施的不良反應（如腸切除、胃切除等外科手術、免疫抑制劑、抗生素、放射性核素的應用）等；微生態環境因素主要包括外襲菌入侵和抗菌藥物的影響等。因此，致病與否決定於腸道微生態平衡與失調的轉換過程。益生菌製劑治療腸道菌群失調克服了抗生素單純殺菌或抑菌的治療取向，而是促進正常菌群充分發揮生物拮抗作用，將致病菌祛除，正所謂“扶正祛邪”，由此也避免了因抗生素濫用造成耐藥株的增加和耐藥因子的擴散等現實難題。目前，在臨床應用較為廣泛的是在腸道疾病中的應用。而應用較多的則是含有雙歧桿菌、腸球菌和乳酸桿菌的培菲康，以雙歧桿菌為主的金雙歧，含有枯草桿菌的美常安，含有腸球菌的整腸生，還有乳酶生、酪酸菌等。
1、益生菌製劑在消化系統疾病中的應用
益生菌（probiotics）具有調整腸道菌群失調，改善微生物環境的作用，故對各種原因引起的急、慢性腹瀉和便祕等消化系統疾病具有良好的預防和治療效果。
1.1腹瀉
益生菌可以通過調節腸道菌群平衡、恢復腸道調節功能、增加定植抗力等機制改善腹瀉患者症狀。一項多中心、隨機、雙盲、平行對照臨床研究表明，受試物件的腹瀉症狀均有明顯的改善，而沒有出現明顯不良反應。此項研究表明，美常安和培菲康治療急慢性腹瀉均能取得滿意療效，二者均促進腸道微生物平衡，對人體發揮有益作用。還有針對真菌性腸炎的治療也表明，使用益生菌製劑治療真菌性腸炎與使用抗真菌藥酮康唑有同樣療效，且無抗真菌藥的不良反應發生，值得臨床推廣。
1.2便祕
益生菌在繁殖過程中產生有機酸，使腸腔PH下降，調節腸道正常蠕動，同時使腸管滲透壓增高，水分的分泌增加，使糞便軟化，從而緩解便祕。針對成人和小孩的試驗結果均表明，益生菌製劑在輔助治療成人功能性便祕和小兒功能性便祕方面均有較好療效。
1.3幽門螺旋桿菌（HP）感染
體外試驗證實，唾液乳桿菌在體外可抑制HP的粘附作用和IL-8的分泌，在預先接種唾液乳桿菌的大鼠胃內HP不能定植在胃黏膜表面。同時，益生菌製劑還可減少或阻止治療HP金標準藥物的不良反應，如結合乳酸桿菌可明顯減輕三聯療法抗HP治療所產生的腹瀉、噁心、味覺障礙等不良反應。
1.4炎症性腸病
炎症性腸病（Inflammatory bowel disease,IBD）是一種多發生於結腸和直腸，易復發、忽重忽輕的慢性炎症性疾病。目前認為與宿主腸道微生態菌群發生紊亂密切相關。IBD主要包括潰瘍性結腸炎（Ulcerative colitis,UC）和克羅恩病（Crohns disease,CD），臨床上主要根據炎症的腸道定位、區域性特徵以及家族性集中情況以及併發症狀況來加以辨別。UC多表現為肛門邊緣的結腸段呈現持續的黏膜炎症，而CD則呈現遍及整個腸道的間斷性炎症，這種炎症反應多是腸道通透性改變所導致的，尤以迴腸段最為典型。
分子生物學分析表明，腸道微生物與其宿主的公共關係是宿主生長髮育所必需的，也是互利共生、長期共同進化的結果。動物模型和人體試驗均表明，IBD普遍存在這種共生關係的機能障礙。因此腸道微生態成為理想而且不良反應很小的治療靶點，然而，文獻報道的應用益生菌治療IBD的臨床試驗結果尚頗具爭議，但是，在應用已知有效治療藥物的同時或後期應用益生菌無疑對恢復腸道菌群和功能有益。
1.5腸易激綜合症（IBS）
國內外均有關於益生菌治療IBS的雙盲、隨機、對照臨床試驗報告，均證實有較好的臨床療效，可以有效緩解IBS的各項症狀，而且發生不良反應的機率均較低。但是，缺乏更加廣泛的多中心臨床研究。
1.6在肝病防治中的應用
肝病患者普遍存在腸道菌群失調並伴有不同程度的腸源性內毒素血癥，一般情況下，菌群失調的嚴重程度與肝功能的損害程度成正比。益生菌製劑能夠使得腸內菌群恢復正常、維護腸粘膜屏障的完整性，吸收利用腸道內含氮有害物質從而減少腸源性內毒素來源和細菌易位，抑制產氨的腐敗菌生長，降低肝硬化患者腸道內酸度、血氨水平和血漿內毒素水平，因而對急慢性肝炎、自發性細菌性腹膜炎等併發症均能起到很好的輔助治療作用。
1.7重症急性胰腺炎
重症急性胰腺炎（SAP）發病急驟，病情複雜，累及臟器多，併發症發病率高，易出現腸道動力障礙、腸道菌群失調、直腸功能紊亂等。因此，保持腸道屏障的完整性對於治療重症急性胰腺炎有重要作用，能夠有效阻止細菌易位，降低全身炎症反應綜合症和繼發多器官系統功能障礙的發生率。實驗證明，SAP早期進行腸內營養時加入益生菌可以減少併發症和減輕病情，縮短住院天數。
2、益生菌的抗癌抗腫瘤作用
益生菌的抗腫瘤作用主要體現在其生成的代謝產物優化腸道菌群的組合，增強了機體免疫功能，同時抗癌益生菌能降解亞硝胺消除其致癌性，此外，益生菌還可以促進腸道蠕動，使得有害菌排除人體外。這些有益作用在結腸癌和肝癌的防治中尤為突出，可能的機理是在降解致癌物如黃麴黴毒素等方面發揮了很重要的作用。
3、益生菌對陰道疾病的調節
乳酸桿菌是陰道正常菌群中最重要、數量最多的常駐菌，佔陰道內常駐菌的95％以上，它通過酵解陰道粘膜上皮細胞內糖元產生乳酸進而維持陰道內酸性環境，抑制有害菌的過度生長，有利於陰道的自潔作用，是維持陰道內菌群平衡的主要細菌。但是，由於年齡增加、廣泛應用抗生素、手術、分娩、陰道灌洗不當、全省性疾病、月經週期中激素的變化、性生活、不良的衛生習慣等因素都可以破壞陰道內微生態平衡，導致陰道內菌群失調，引發陰道疾病，常見的有細菌性陰道病和滴蟲性陰道炎。細菌性陰道疾病主要表現為陰道內乳酸桿菌顯著減少或完全消失的菌群失調，而滴蟲性陰道炎屬於性傳播疾病，發病率較高，主要表現為陰道分泌物的滴蟲、支原體、鏈球菌以及厭氧菌群的分離率增加，其他微生物變化不明顯。研究表明，以益生菌中的產H2O2乳桿菌區域性應用，均可以達到較高的有效率。
4、臨床應用益生菌製劑的注意事項
臨床應用益生菌製劑，應該注意以下幾點：
4.1合理應用抗生素，同時使用抗生素和微生態製劑是否影響活菌製劑的功效是值得注意的問題。實驗表明，整腸生因對環丙沙星、氧氟沙星、慶大黴素、妥布黴素、多西環素、頭孢唑啉鈉、頭孢拉定、頭孢氨苄、阿莫西林/克拉維酸鉀、呋喃唑酮、甲硝唑等28種抗生素敏感而不能同時使用，但它與紅黴素、阿奇黴素、克林黴素等因為耐藥而可以同時使用。而培菲康不宜與萬古黴素、環丙沙星、複方哌拉西林、四環素、複方磺胺甲唑、氨苄西林、甲硝唑等同時服用。
4.2根據不同病症，合理選用微生態製劑：有學者研究培菲康治療嬰兒腹瀉的療效優於整腸生等多種微生態製劑的聯合應用，所以，不可盲目採用多種微生態製劑的聯合應用。
4.3儲存條件及保管：微生態製劑的活菌數及存活時間與儲存條件密切相關，活菌一般都有怕光、怕熱、怕溼等特點，溫度越高、溼度越大，活菌存活時間越短，不正確的儲存條件可能會嚴重影響療效。有些製劑如培菲康、金雙歧和常樂康等標明瞭冷處儲存，也有的製劑沒有特殊要求，有效期可達24個月，給銷售和患者均帶來了很大方便，有利於提高患者依從性和治療效果。
4.4注意服用方法：培菲康、麗珠腸樂等製劑不能耐受熱和胃酸，需要飯後服用，也不宜用熱水而應該用溫水送服。
5、益生菌的安全性
益生菌製劑是一類對肝腎功能影響較小、較為安全的製劑，主要應該觀察過敏反應，但也有關於一些病人用藥後發生菌血症、敗血症和膽管炎等不良反應的報道，需要指出的是，沒有直接證據確認一定就是益生菌引起了這些感染，因為所報道者均患有潛在的疾病，對於免疫功能缺陷者、抵抗力差的老人需要謹慎使用。
益生菌製劑作為一個新興產業，在臨床均有廣闊的前景，理應受到廣泛關注，只要我們科學研製、合理使用，或許能夠給臨床帶來意想不到的非凡效果。
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