在ART治療中，通常實驗室是按照形態學評分系統對胚胎進行評分，預測其發育潛能。胚胎形態學評分方法是對不同發育時期的胚胎進行形態學評分，包括受精後16 ~ 20 h原核期胚胎、移植後第3天（day3，D3）胚胎及囊胚。
受精後16 ~ 20 h出現原核，原核期胚胎的評分系統包括對原核的數目，大小，相互位置以及核仁的數量，大小、分佈及胞質情況進行評估。兩個原核並列相連，大小一致，兩個原核中核仁大小數目相同，線性排列於原核連線處的合子評分最高，發育潛能最強。原核大小不等或分離，兩個原核中核仁數量不等，分佈不規則的合子評分較低。多個原核的合子染色體異常，不用於移植。
卵裂期胚胎移植時，主要將D3胚胎評分作為胚胎移植的選擇標準。D3胚胎評分系統主要依據D3胚胎的卵裂球數目、排列以及碎片比例進行評分。卵裂球大小均勻，沒有碎片的胚胎評分最高。另外，8細胞的胚胎臨床妊娠率最高，優先選擇8細胞胚胎移植。實踐中選擇胚胎通常聯合原核評分及D3胚胎形態評分判斷胚胎髮育潛能。
囊胚培養具有篩選胚胎的作用，有助於提高臨床妊娠率。按照囊胚腔大小，是否孵化，可將囊胚分為1~6級，3~6級為可用來移植的囊胚。再根據細胞數量，排列是否緊密將內細胞團和滋養層分別評為A~D級，A級最高，D級不用於移植。
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