抗核抗體陽性對自身免疫病的診斷、病情判斷、療效評價中具有重要的意義，但就目前研究結果而言，抗核抗體一般不能轉陰。
首先，抗核抗體非單一抗體，而是一組具有不同臨床意義的自身抗體組合，如抗雙鏈DNA抗體、抗Sm抗體、抗組蛋白抗體、抗著絲點抗體、抗SSA抗體、抗SSB抗體等。不同型別的抗核抗體臨床意義各不相同，但整體而言，抗核抗體在自身免疫病診斷中的意義要大於對病情判斷、療效評價的作用，即抗核抗體像一個標籤一樣存在於自身免疫病患者體內，用以區別非自身免疫病人群。
其次，抗體抗體是由於人體內免疫系統功能異常，不能識別人體正常組織成分，而將其當作外來“異物”，誘發異常免疫反應所產生的自身抗體。其水平高低與病情輕重程度有一定的相關性，當病情嚴重，或處於急性期時，抗核抗體水平較高；經過激素、免疫抑制劑治療有效後，抗核抗體水平可以下降。但由於目前自身免疫病不能根治，通過藥物治療可以抑制體內異常免疫反應，因此抗核抗體合成減少，水平下降，少數患者抗核抗體水平甚至可降至檢測範圍最低值以下，表現為“陰性”，但若病情活動，其水平可再次升高。
因此，抗核抗體陽性一般是不能轉陰的，其臨床意義更多在於自身免疫病的診斷。患者更應該關注病情整體控制情況，預防和減少併發症的出現。
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