腎結石的治療需要根據結石的大小採取不同的治療方法，6mm以下的結石，可以選擇口服排石藥排石，6mm以上的結石，需要直接取出或碎石後取出。採用什麼方案進行碎石後取石要考慮結石的大小和位置。
直徑不超過2cm的腎結石都可以進行體外衝擊波碎石。體外衝擊波碎石後隨尿液排出體外。但結石如果過大，就不一定適合進行體外衝擊波碎石。因為碎石治療的次數可能增多，碎石量大，可導致腎功能損害。如結石太小，體外衝擊波碎石也容易導致腎損傷。所以，體外衝擊波碎石治療的適應大小為2cm以下結石。
對於2cm以上的結石，推薦進行輸尿管軟鏡碎石取石術或者經皮腎鏡碎石取石術。經皮腎鏡碎石取石術建立經皮通道以後，在腎鏡下直接取石或碎石。
對於<2cm,透X線，體外衝擊波碎石困難的結石，可以選擇輸尿管軟鏡下的碎石。經輸尿管逆行進入腎盂腎盞，碎石後取出。
是否進行碎石，也不是隻單單根據腎臟的結石大小，要看是否引起腎臟積水、引起腎臟感染。如果結石合併腎臟積水、腎盞積水，或者患者出現腰痛症狀，需進行積極的體外碎石或者手術干預治療。
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