補牙會有一定的疼痛，和牙齒齲壞的深度有關。
補牙是去除齲壞的牙體硬組織，然後進行牙齒的充填。在去除齲壞的牙體硬組織的同時，也對牙髓組織產生一定的鑽磨的壓力，牙神經會有一定的反應。如果牙齒齲壞比較淺，距離牙神經比較遠，鑽牙的過程中，不會有明顯的疼痛，可能會有輕度的不適。如果牙齒齲壞比較深離牙神經比較近，鑽牙的過程中就會有明顯的疼痛。
補牙之後也會出現不同程度的疼痛。如果補牙的過程中有小的露髓孔沒有被發現，補牙之後就會出現明顯的疼痛，這種疼痛是很劇烈的，有時會放射到同側的頭頸部，而且很難分清是哪一顆牙齒出現的疼痛。或者是補牙過程中，充填材料過高形成咬合創傷，引起根尖區的疼痛。或者是充填材料沒有很好的恢復鄰面的接觸點，出現懸突，也會引起牙齒的疼痛。
所以補牙如果牙齒齲壞比較深，或者是補牙後材料過高都會有明顯的疼痛。
如疼痛明顯，也可考慮在區域性麻醉下，進行補牙治療。
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