寶寶睡覺搖頭一般會出現在嬰幼兒時期，環境因素、維生素D缺乏性佝僂病、癲癇、飲食不當等都會引起。
首先，環境因素會導致孩子睡覺搖頭，如睡眠環境的吵雜寶寶會因為被驚嚇而出現搖頭的現象，改善睡眠環境之後寶寶的症狀就會緩解。被子蓋的太厚、衣服包裹的比較多也會因為太熱導致寶寶睡覺不踏實，摸摸寶寶的頭上會有汗，減少衣物就可以。
其次，維生素D缺乏性佝僂病可以導致，寶寶睡覺時翻來覆去的表現，並且會有枕禿、易驚的伴隨症狀，通過補充維生素D大部分症狀可以緩解。癲癇也可以導致類似的臨床表現，如肌陣攣發作，以多個肢體振幅小、每秒1～3次的肌肉痙攣為特徵，其抽搐可迅速地從一個肢體轉向另一個肢體，或由身體的一側轉向另一側，可以通過腦電圖檢查明確診斷。
最後，飲食不當也會導致寶寶睡覺不踏實，寶寶在睡前吃了太多食物因為消化不良導致了腹脹引起睡覺搖頭。臨床上很多疾病都會引起寶寶睡覺搖頭，找準病因對症治療後一般效果良好。
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