治療肛裂最有效的方法為手術切除，其術後的恢復時間需根據患者肛裂的嚴重程度及自身體質而定，並不能一概而論。
肛裂微創手術通常在肛門內括約肌處切開，若患者症狀較輕、切口小於1cm，一般術後1-2周即可逐漸好轉，疼痛減輕。但由於肛周細菌較多，再加上每天排便刺激，可延緩傷口癒合時間，等到傷口完全恢復可能需要1個月左右。如果肛裂較為嚴重，病灶累及較深，手術切口大於1cm，則此時患者恢復會較為緩慢，通常需要1個月左右疼痛才能減輕。但具體多長時間才能恢復，還需根據患者自身恢復能力及術後保養而定，時間長者甚至可達數月。
建議患者術後注意調整飲食結構，不可暴飲暴食，不可飲酒，不可食用辛辣刺激食物，多吃富含纖維素的蔬菜水果，以避免或減少便祕的產生；同時注意肛周衛生，便後可用溫水或高錳酸鉀溶液坐浴，以促進傷口儘快恢復。
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