肛周膿腫術後癒合時間取決於病灶大小、手術方式、術中切除範圍等因素，短則2-4周，長則2-3個月。
肛周膿腫如果體積較小，可進行切開引流的治療，術後癒合時間較短，連續換藥2周即可癒合；如膿腫體積較大、牽涉範圍較廣、合併肛瘻或位於直腸周圍間隙者，癒合較長，行根治性切除術後4-6周可癒合；如患者年老體弱、合併糖尿病、血液疾病、結核、營養不良或貧血等，癒合時間可超過2-3個月，屬於傷口延遲癒合。
此外，患者術後需每天需用高錳酸鉀溶液坐浴，每天換藥清洗傷口，補充富含維生素和優質蛋白的食物，禁食辛辣、油膩食物，保持大便通暢，同時需注意休息。
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