目前臨床上治療肝癌的方法有多種，其適應症各有不同，效果亦相差甚遠。
簡單介紹如下：
1、肝癌的肝切除術：在過去、現在和將來很長的一段時間內，肝切除術是除肝移植以外最主要的治療手段，只要病人全身情況允許(心、肺、腎等器官功能良好)，肝癌侷限於肝臟一葉或一段，估計切除術後殘存的肝臟功能足以維持病人生命，就可以行根治性切除。切除術後硬化的肝臟還在，肝癌復發或再發率較高，且肝硬化進行性發展，可能出現肝功失代償及門靜脈高壓徵的併發症(上消化道出血、肝性腦病、頑固性腹水等)而危及病人生命。
2、肝移植術：
肝移植是目前可能治癒肝癌的唯一手段，肝移植同時解決了三個問題，
(1)肝癌;
(2)肝硬化;
(3)慢性乙型肝炎。
肝移植術後病人可恢復正常的生活，有較高的生活質量，但肝移植手術費用較高，術後需長期服用免疫抑制劑是其缺點。適應證：肝癌病灶侷限於肝內、無遠處器官轉移，全身其他臟器功能可以耐受手術。
3、介入治療：
包括肝動脈化療(HAI)、肝動脈栓塞(HAE)及化療性栓塞(TACE)，單純給予HAI是不夠的，化療性栓塞(TACE)是目前最主要的介入治療方法。
適應證：
(1)不能手術切除的中晚期原發性肝癌患者;
(2)能手術切除，但由於其他原因(例如高齡、嚴重肝硬化等)不能或不願進行手術的患者。對於上述患者，放射介入治療可以作為非手術治療中的首選方法。
4、消融治療：是指影像技術引導下在區域性直接殺滅腫瘤的一類治療手段，目前以射頻和微波消融及無水酒精注射最為常用。
適應證：
對直徑≤5cm的單發腫瘤或最大直徑≤3 cm的3個以內多髮結節，無血管、膽管侵犯或遠處轉移，肝功能Child-Pugh A或B級的早期肝癌患者，射頻或微波消融是外科手術以外的最好選擇。
5、放射治療：
放射治療是惡性腫瘤治療的基本手段之一，但在20世紀90年代以前，由於放療效果較差，且對肝臟損傷較大，因此原發性肝癌患者較少接受放療。20世紀90年代中期之後，三維適形放療和調強適形放療等現代放療技術逐漸成熟，為放療在肝癌治療中的應用提供了新的機會。
肝癌的放療指徵：
（1）腫瘤侷限，因肝功能不佳不能進行手術切除，或腫瘤位於重要解剖結構，在技術上無法切除，或拒絕手術。
（2）手術後有殘留病灶者。
（3）需要肝臟區域性腫瘤處理，否則會產生一些併發症，如肝門膽管的梗阻、門靜脈和肝靜脈的瘤栓，對肝門膽管的梗阻患者可以先進行引流，緩解黃疸，再進行放療。
（4）遠處轉移灶的治療，如淋巴結轉移、腎上腺轉移以及骨轉移，放療可減輕患者的症狀，改善生活質量。
6、生物治療與分子靶向治療：大多數生物治療方法或技術尚處於研發和臨床試驗階段，小部分已應用於臨床。近年來，分子靶向藥物治療肝癌已成為新的研究熱點, 受到高度的關注。
主要包括:
（1）抗EGFR藥物，如埃羅替尼和西妥昔單抗;
（2）抗血管生成藥物，如貝伐單抗和Brivanib等;
（3）訊號傳導通路抑制劑，如mTOR抑制劑依維莫司;
（4）多靶點抑制劑，如索拉非尼和舒尼替等。
7、中醫藥治療：目前認為中醫藥可以作為肝癌的輔助治療，有助於減少放、化療的毒性，改善癌症相關症狀，提高生存質量，並且有可能延長生存。
8、原發性肝癌的系統化療：早在20世紀50年代起，系統性化療就用於治療原發性肝癌。多數傳統的化療藥物，包括阿黴素(ADM)、5-氟脲嘧啶(5-Fu)、順鉑(PDD)和絲裂黴素(MMC)等，都曾經試用來治療肝癌，但單藥有效率都比較低。
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