肛門溼疹的發病原因很複雜，其發病原因有以下幾個方面：
（1）肛門疾病：如痔瘡、肛瘻、肛裂、肛門失禁、肛管上皮缺損等。
（2）體質因素：有人認為素質差與本病有重要關係。
（3）飲食因素：魚、蝦、蟹、牛羊肉、雞蛋、蔥、蒜、酒等。
（4）藥物影響：磺胺類藥物、某些抗生素及強酸、強鹼等化學藥品。
（5）精神因素：精神緊張、勞倦、憂鬱、失眠亦可引起。
（6）致敏物質：如花粉、灰塵、羊毛、人造纖維、香脂、染料、肥皂等。
（7）疾病因素：如內分泌失調，肝腎功能紊亂，腸道寄生蟲病，消化功能紊亂，婦女白帶多，嬈蟲病等，均可引起或加重病情。
（8）其它：炎熱、潮溼、寒冷、日光等氣候影響，亦是其致病因素。
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