移植到子宮腔的胚胎沒有著床成功，對病人而言是很大的打擊，也困擾著生殖中心的醫生們。甚至有些不孕症患者屢做屢敗，除了錢財的花費不貲外，對患者身心的創傷也是很大。為什麼植入的胚胎不能著床成功，一直是大家困擾且極想知道的話題。目前認為可能主要與下面一些因素有關：
子宮內膜接納能力不足
（1）宮腔存在異常病變，如：子宮先天發育畸形（雙角子宮、縱膈子宮）、子宮內膜息肉、子宮內膜炎和肌瘤等。
（2）子宮內膜薄：流產後多次清宮、月經不正常（持續月經來潮）或血液迴圈不好，都會造成子宮內膜偏薄。
（3） 輸卵管積水返流入宮腔：輸卵管積水因輸卵管傘部（尾端）阻塞往子宮腔流之故。持續性的子宮腔積水會造成胚胎著床失敗。
（4）子宮內膜細胞分泌的粘附分子等存在量和質異常等。
胚胎本身存在缺陷
目前發現重複試管嬰兒助孕失敗的案例中，胚胎染色體異常的比例高達60％，所以很多植入子宮內的胚胎著床失敗是因為胚胎本身染色體異常所致。這些染色體異常的胚胎有時外表看起來細胞大小正常、分裂速度也正常且在胚胎分級上是屬於一級或二級的優良胚胎。而且女性年齡越大，胚胎不正常的機會也越大。另外，女性年齡大引起的卵子透明帶變厚、變硬及體外培養環境等因素都可能損害胚胎，引起胚胎著床失敗。
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