腸鏡檢查的成敗，腸道的清潔度是關鍵因素之一。如果檢查時腸道仍有許多糞便，就會影響進鏡和觀察，甚至不能完成全大腸檢查。因此，檢查前腸道的清潔準備十分重要：
1、檢查前一日晚餐進半流質少渣飲食，如稀飯等，不吃蔬菜及西瓜等帶籽水果。
2、於檢查前4小時左右，成人50克、兒童25-35克硫酸鎂粉加溫開水100毫升口服，此後1小時內口服溫開水2000-2500毫升。
3、可根據醫囑服用其它種類瀉藥，如聚乙二醇電解質散劑、磷酸鈉鹽口服溶液等。
4、一般半小時左右後即開始排便，連瀉5-7次即可基本排清大腸內糞便。部分患者在腸道準備過程中會發生嘔吐，這可能與硫酸鎂的刺激及短時間內大量飲水有關，可將硫酸鎂混入飲料後口服，然後緩慢口服白開水，以不感到明顯腹脹為標準。
5、若飲水結束4小時後仍未排便，則為無效，即應前往醫院就診，在醫生指導下做腸道準備，或重新預約檢查時間。
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