由於包皮口狹窄，陰莖頭任何情況下都不能露出，以致排尿不暢，造成泌尿繫上行感染和腎功能損害就成為首要問題。且無法清洗包皮腔，包皮垢長期堆積，在炎症的同時外觀上看，冠狀溝等處會有一個個的明顯的凸起小包。包莖與包皮過長的危害有相同點，但是從病情程度講，包莖甚於包皮過長。包莖必須儘早做手術治療。
1、新生兒包皮口狹窄，排尿費力。新生兒的尿路特點是腎盂和輸尿管較寬，輸尿管管壁肌肉和彈力纖維發育不良、彎曲度大，易被擠壓和扭轉，容易出現尿瀦留而致感染。
新生兒膀胱―輸尿管連線處的瓣膜機能較弱，當膀胱充盈，膀胱內壓力增高時，尿液繼續向上反流引起腎臟感染。由於新生兒和嬰幼兒發生泌尿系感染時泌尿系症狀不典型或無法表達，且常以發熱、拒食等全身症狀為主，容易誤導家長以感冒、消化不良等治療，延誤病情。
2、影響陰莖發育。包莖時包皮緊緊包住龜頭，陰莖發育受到束縛，致使陰莖的長度和直徑小於同齡兒童。
3、陰莖頭炎、包皮炎、尿道口炎反覆發作。包皮腔記憶體積的皮脂腺分泌物、尿液和面板脫屑是細菌的良好培養基，腔內溫度、溼度升高，細菌滋生，引起區域性炎症反覆發作。
4、誘發泌尿、生殖系炎症。如果包皮腔內細菌等上行感染，可能引起尿道炎、膀胱炎等泌尿系炎症;此外還可引起前列腺炎、精囊炎甚至輸精管炎、附睪炎和睪丸炎，從而影響精液和精子質量，嚴重的可能影響男性生育。
5、包莖是誘發陰莖癌的常見因素。長期區域性炎症刺激，可能誘發陰莖癌或癌前病變，如陰莖角、陰莖乳頭狀瘤、陰莖白斑、增殖性陰莖紅斑症等，也可能誘發女性宮頸癌。
6、腎損害。嚴重的包莖，包皮口可能極為狹窄，排尿極為不暢，排尿時膀胱括約肌收縮，膀胱內壓在克服尿道阻力之前或同時，也超過了膀胱壁內段所能承受的壓力，尿液可沿輸尿管返流，輸尿管、腎盂擴張，引起上尿路細菌感染，疤痕形成，導致繼發性反流性腎臟病甚至腎功能損害。
7、包皮粘連。長期的緊密包裹和反覆炎症導致部分患者的包皮和陰莖頭髮生粘連，界限不清晰。
8、影響性生活質量。包皮長期包裹，影響陰莖頭、陰莖的發育，出現小陰莖陰莖，影響性生活質量。且性生活時陰莖的敏感部位主要是陰莖頭、包皮和繫帶部分，陰莖頭被包裹，敏感度低性體驗不佳而無法勃起，且由於束縛較緊，勃起時出現疼痛，影響性慾。(更多專業資訊請關注“男科筆記”)
9、生活質量下降。炎症持續發作，瘙癢疼痛難忍，自身生活質量嚴重下降。
10、對配偶健康的影響。包莖長期不能清洗包皮腔，導致包皮垢堆積嚴重，細菌滋生，性生活後對配偶的健康影響，要遠遠超過包皮過長的危害。實驗證明，包皮垢是一種化學致癌物質，具有較強的致癌作用，如將人的包皮垢接種小鼠，可誘發雌鼠宮頸癌。
注：此資訊源于網路收集，如有健康問題請及時咨詢專業醫生。