生殖器皰疹有很大的危害性。生殖器皰疹在最嚴重的時候可能會導致女性不孕。生殖器皰疹是一個好治療的疾病，但是在治療之後生殖器皰疹很容易就會復發。尤其是妊娠中的女性，生殖器皰疹在懷孕期間就復發，會造成什麼樣的影響。
在臨床工作中，我們注意到，有些患者自我感覺良好，實際上，醫學檢查卻提示她們的免疫力並不高，有的甚至合併免疫缺陷，她們的症狀往往會在一年之中反覆發作多次，這種人群就比較危險。另一方面，妊娠對婦女來說是個挑戰，她們自身的免疫力也會隨之而發生變化，所以，為保險起見，建議有生殖器皰疹病史的孕婦做個血液免疫學檢查，以明確自身的情況。
對於那些免疫力低下的孕婦來說，病毒進入血液引起病毒血症，出現播散性感染的概率大大增加，孕婦可能因此而出現全身症狀，引起全身多個器官的損害，這時不要說胎兒會死亡、流產，就是母親的生命安全都會受到威脅。
對於抵抗力正常、症狀侷限的患者(絕大多數孕婦屬於這類情況)，病毒在母體的分佈情況如下：HSV主要侷限於感染灶部位，也就是生殖器、肛周等處;部分可由於淋巴迴流導致周圍淋巴結炎，但感染通常很侷限，不會大規模擴散;小部分可沿周圍感覺神經上行，並潛伏於骶神經;病毒一般不進入血液，不引起病毒血症。
HSV不會通過血液在身體各器官間相互傳播，它既不到達胎盤，更不能通過胎盤進入胎兒體內，因此，HSV對胎兒的影響也就無從談起了。據多個國家歷時20年的大規模調查顯示，與正常孕婦相比，孕母感染HSV並不會增加胎兒畸形和流產的比例。但動物實驗觀察的結果則跟調查結論有所不同，所以目前醫學上對這點尚存爭議。
我們知道，妊娠是一個特殊的過程，這期間，孕婦用藥稍有不慎，就可能影響腹中胎兒的生長髮育。一般情況下，生殖器皰疹對孕婦和胎兒並沒有很大影響。因此，目前臨床上對孕期生殖器皰疹的治療偏於保守，主要是採取措施緩解症狀。在沒有病毒血症的情況下，建議孕婦以外用藥為主，如外搽抗病毒的藥物，直至症狀消失。
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