從女性外生殖器官的構造可以看出：女性的陰道口與尿道口、肛門鄰近，而陰道口是女性內生殖器官與外界相通的開口，因此女性生殖器官容易受到外界致病因素的侵擾。但是，女性生殖道、生殖器官在解剖和功能方面有其比較完善的自然防禦系統，因此並不會稍有病原體侵犯即引起婦科感染。
這種自然防禦系統包括：
1、女性外陰的大、小陰脣兩側相合，像兩道門一樣將陰道口、尿道口遮掩起來。
2、女性骨盆底有許多肌肉組織。在這些盆底肌肉的作用下，使陰道口平時處於閉合狀態，陰道前、後壁緊貼，從而抵禦外界致病因素的侵入。但對經產婦而言，陰道壁比較鬆弛，這項功能會有所減弱。
3、婦女卵巢分泌的雌激素能促使陰道上皮細胞增生變厚，對病原體的抵抗力增強。另外，陰道上皮細胞內含有豐富的糖原，而正常婦女的陰道中寄生著一種叫陰道乳酸桿菌的細菌，它能使這些糖原分解為單糖，再分解成乳酸，使陰道內環境呈酸性，pH值保持在4.2～5。那些宜於在鹼性環境中生長的病原體因此會受到抑制，這就是陰道的自淨作用。
4、在卵巢分泌的性激素的作用下，子宮頸黏膜的腺體能分泌出鹼性黏液，形成黏液栓，堵塞宮頸管，將子宮頸管與外界環境隔離開，減少了細菌侵入的可能。曾有報道：在宮頸黏液栓的下1/3可以查出細菌，而黏液栓的上2/3則沒有細菌查出。這可以說明，宮頸黏液栓對防止細菌上行感染有重要作用。另外，宮頸內口平時也處於閉合狀態，同樣可以阻止病原體的入侵。
5、隨著卵巢分泌的性激素的週期性變化，育齡期婦女的子宮內膜也發生週期性的剝脫，產生月經。隨著子宮內膜的剝脫和經血的排出，侵入宮腔的病原體也得到清除的機會。
6、輸卵管黏膜的上皮細胞有些分化成纖毛細胞，這些纖毛能夠向子宮方向擺動，加之輸卵管的蠕動作用，都會對侵入輸卵管的致病菌起到清除作用。
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