肥胖對性功能有一定影響。
對於肥胖男性而言，重度肥胖者體內的遊離睪丸酮(也就是具有生理活性的那一部分睪丸酮)水平較正常人低，而且在做興奮試驗時的升高程度也遠遠不如普通人。另一方面，雌激素是在脂肪組織內產生的，脂肪組織越多，雌激素合成越多。所以肥胖男性體內的雌激素水平比普通男性要高，少數人甚至可以因此而產生陽痿以及乳房發育等女性化表現。所以總的來說，肥胖男性的性慾以及性功能有可能下降。
肥胖女性的情況與男性有所不同，由於高胰島素血癥可以刺激卵巢產生過多的雄激素，所以體內的遊離睪丸酮水平可能比普通女性高，導致女性出現多毛等男性化表現，還可引起月經紊亂甚至閉經、不育。另外，肥胖女性往往容易合併黑棘皮病，表現為脖子、腋下和大腿根部面板又黑又粗。肥胖女性的面板還容易長癬、長癤子，再加上男性化表現，非常影響婦女的容貌，對性生活造成不良的心理影響。
肥胖還對性交體位的選擇有所限制，不利於性生活的質量。
肥胖者容易患糖尿病，有糖尿病的男性可繼發陽痿，女性可因此而出現性冷淡和陰道炎，可能進一步影響性功能。
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