導致陰莖和陰囊水腫的原因很多，陰莖和陰囊水腫發病時症狀多為發病部位有水腫樣，伴有疼痛感，嚴重時可導致排尿不利和行走不便。由於陰莖和陰囊水腫直觀上表現為患病部位產生水腫腫大，且男性生殖部位許多疾病發病時也會產生水腫等現象，對於診斷陰莖和陰囊水腫則需與以下疾病相鑑別：
1、陰囊水腫：陰囊為疏鬆組織很易出現水腫，即可為全身性水腫的一部分，也可為區域性因素所致，如區域性炎症或過敏反應、靜脈血或淋巴液迴流受阻等;張力性腹水可引起陰囊顯著腫脹;後腹膜出血(如腹主動脈瘤破裂)出現非創傷性陰莖陰囊瘀斑，又稱Bryant藍生殖器徵。
2、陰囊象皮腫：陰囊腫脹、面板粗糙、增厚如象皮樣。常由於血絲蟲病引起的淋巴管炎或淋巴管阻塞所致，衣原體引起的性病淋巴肉芽腫，晚期也可出現陰囊象皮腫。
3、陰囊疝：陰囊疝是指腸管或腸繫膜等腹腔內器官，經腹股溝管下降至陰囊內的腹股溝斜疝。表現為一側或雙側陰囊腫大，觸之有囊樣感。有時仰臥位或用手可推回腹腔，但咳嗽或其他原因使腹腔內壓增高時可再降入陰囊。
4、鞘膜積液：陰囊腫大觸之無痛，有水囊樣感，且總是位於睪丸的前方，多為睪丸鞘膜積液。
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