近二十年來，隨著肝臟外科基礎研究的進展，影像學的發展，麻醉學的進步，手術器械的不斷革新以及圍手術期管理水平的提高，肝切除術已為眾多外科醫生所掌握。但不可否認的是，肝切除術尤其是大塊肝切除與一些特殊部位的肝切除仍然有較高的併發症發生率與一定的手術死亡率。總體而言，肝切除術仍然是目前安全性有待進一步提高的高風險手術。具體來講，主要有以下幾方面。
腹腔內出血：術中或術後出血是肝切除術的最常見且嚴重的併發症，也是肝切除術死亡的主要原因之一。引起術中大出血的主要原因有血管損傷、腫瘤與周圍臟器的廣泛粘連以及凝血功能障礙等。血管損傷引起的大出血，大多是因為腫瘤位置特殊，或切除過程中在理較粗大的血管時，因解剖不清或方法不當，損傷血管，引起的大出血，尤其對於存在肝內管道變異的患者，更易發生。此外，在斷肝過程中來自肝靜脈分支的出血處理亦比較棘手。對於腫瘤與周圍臟器有廣泛粘連，尤其是與膈肌有廣泛粘連或侵犯者，遊離肝臟過程中往往會發生手術分離面的廣泛出血，且難以控制。對因凝血功能障礙所引起的出血，應及時補充足量的新鮮血漿、凝血酶原複合物、纖維蛋白原等，並儘快結束手術，否則極有可能發生嚴重後果。術後出血原因很多，常見的有術中止血不徹底；血管結紮線脫落；肝斷面組織壞死繼發感染；引流不暢，創面積液感染，腐蝕血管；患者凝血功能障礙等。
肝衰竭：肝衰竭是導致術後死亡的重要原因。肝切除後的肝功能損害與肝臟病變、肝硬化程度、肝切除量、麻醉以及術中出血量等因素密切相關。
膽漏：常見原因為肝斷面膽管漏扎、結紮線脫落或肝臟區域性組織壞死脫落所致。若引流通暢，患者可無特殊不適症狀，但引流管需妥善保護好，並需保留較長時間。若引流不暢，漏出的膽汁積聚於膈下或肝下，可引起高熱，脈搏、呼吸加快等症狀，嚴重者可引起區域性感染、瀰漫性腹膜炎等。
切口感染和切口裂開：常見原因為合併有膽道感染，腹腔感染，曾行多次腹部手術，手術切口沿用上次手術的舊切口，肝功能差，劇烈咳嗽，合併有糖尿病，營養不良，大量腹水等。
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