無論是甲狀腺全清除術或是次全切除術，都會不同程度地留下一部分正常的甲狀腺組織。正常的甲狀腺濾泡攝取碘131的能力強於分化型甲狀腺癌細胞，因此檢查劑量的碘131一般不易明確顯示頸部和遠端轉移灶，尤其是較小或彌慢性轉移灶。
通過碘清甲治療不僅可以將這些的甲狀腺組織和包含在內的淺在癌病灶以及早期的轉移灶一併清除，而且可以明確診斷殘留甲狀腺組織外是否存在攝碘性轉移灶，並可因此採取進一步的治療。近半數以上的患者經一次較大劑量的碘131治療即可清除全部的殘留甲狀腺組織。
其他病人可能需要2至3次重複性治療。即使碘131清甲治療後未發現甲狀腺癌轉移灶存在，採用適量的甲狀腺激素永久性替代治療，是目前防止甲狀腺癌復發和轉移的最有效方法。
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