慢性腎衰竭疾病的病因當中，慢性腎衰竭可謂是各種進展性腎病的最終結局，所以說導致慢性腎衰竭發生起病的原因大多數就是慢性的腎病。人體的腎臟自身的病變其實也就是慢性腎衰竭發病的原因。這一類腎病所引發的腎衰竭大概約佔慢性腎功能衰竭疾病原因的70%以上。比如各類慢性腎小球腎炎，腎病綜合症，慢性間質性腎炎，腎結石，腎囊腫，腎動脈狹窄，腎小管酸中毒等等，都是很有可能會引發慢性腎衰竭疾病的。
關於引發慢性腎衰竭疾病的原因，全身性疾病與中毒其實也會引發腎衰竭疾病的。全身系統性疾病均可能會影響腎臟疾病的，最終導致腎功能的衰竭，比如說長期高血壓、糖尿病以及系統性紅斑狼瘡，都是有可能併發腎衰竭的。
過敏性紫癜，妊高症，肝硬化，痛風，以及各種鎮痛劑，氨基甙類抗生素(比如說慶大黴素，卡那黴素等)以及重金屬(例如鉛，鎘，鋰等)和中毒性腎病等等，都是很容易導致慢性腎衰竭疾病的。另外，慢性腎衰竭患者還需要忌食高嘌呤的食物，比如動物內臟、海鮮以及菠菜和菇類等等。
下泌尿系梗阻也是造成慢性腎衰竭疾病的原因之一。比如說前列腺肥大或者是腫瘤，尿道狹窄，尿道結石以及神經性膀胱功能障礙等等，都非常容易造成繼發性的感染，患者體內反覆感染從而引起患者的慢性腎功能衰竭情況，因為這一類原因從而發生的慢性腎衰竭疾病，大概佔總發病率的百分之十五左右。慢性腎衰竭患者需要禁用新黴素，鏈黴素慶大黴素等等藥物。
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