在臨床上，不同性質、不同大小的囊腫引起的症狀均不相同。
卵巢內腫瘤是女性生殖器常見腫瘤，形態各不相同，性質也不相同。有囊性、實性、良性和惡性之分，以囊性最為多見。卵巢囊腫早期時多無明顯的症狀及體徵，多於婦科檢查彩超時發現，可暫不予處理，定期行彩超檢查觀察其動態改變。中等大小的卵巢囊腫可能會引起腹內包塊，具有可移動性，往往可以從盆腔移至腹腔；還可引起腹痛，腹脹，甚至不規則的陰道出血等情況。此時建議及時醫院就醫，給予對症處理，若卵巢囊腫增大，且合併感染時，可行手術治療，手術採取卵巢囊腫切除術，適用於年輕患者尤其是絕經前患者，儘可能保留正常的卵巢組織；輸卵管卵巢切除術，適用於年齡較大或絕經後患者，可行一側或雙側輸卵管卵巢切除術。
良性卵巢囊腫大多數情況下沒有明顯的症狀，常見的症狀表現就是小腹疼痛，陰道不規則出血。若長期未得到有效的治療，對女性的懷孕也是有影響，同時還會有轉變為惡性的機率。
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