結膜炎是眼科最常見的疾病。治療結膜炎，首先要查詢病因。
導致結膜炎有很多原因，最常見的就是微生物感染，可能是細菌感染，病毒感染，或者是衣原體感染，偶爾也可以見到真菌，立克次體和寄生蟲感染。有些是因為物理性的刺激或化學性的損傷引起的，比如風沙，煙塵，紫外線或者是有毒的氣體液體等等。還有一部分的結膜炎可能是免疫性的病變，比如說過敏性反應，也有可能是全身的疾病導致的，還有可能是臨近的組織炎症蔓延過來，比如說角膜炎，鞏膜炎等等。
明確病因是關鍵，通常需要針對病因治療。細菌性結膜炎，在急性期以抗生素滴眼液／膏為主；病毒性結膜炎以抗病毒眼藥水為主；沙眼衣原體引起的沙眼以利福平、金黴素等眼藥水／膏治療。如果是過敏性結膜炎，需要用抗過敏的眼藥水治療。
一般選用區域性滴眼藥水以及眼藥膏治療，沒有特殊情況，不會選用全身治療。大多數型別的結膜炎治癒以後，不會留下併發症，少數因為併發角膜炎症，會有一定的視力下降。有些病人還可能遺留乾眼症。所以，人們平時儘量要注意多洗手，養成良好的衛生習慣，預防為先。
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