長期便祕會影響脾胃的執行，造成大腸功能的紊亂。臨床上治療便祕的方法首先是藥物調理，還有就是灌腸。當然，必要的日常生活習慣以及飲食習慣的調護也是可以改善便祕的。
治療便祕並沒有什麼特效的方法。根據便祕程度的不同，治療方法也不同。一般可採用生活調理、藥物治療、生物反饋訓練和手術治療。要重視生活治療，積極調整心態，對獲得有效治療均極為重要。若為結腸傳輸功能障礙型便祕、病情嚴重者可考慮手術治療。臨床上有很多中藥材也可以緩解便祕，如蘆薈、大黃、番瀉葉、決明子以及含有這些成分的通便茶。此外，甘油、開塞露等潤滑劑，可以刺激腸道收縮引起排便。嚴重的便祕可以灌腸洗腸。隨著科技的發展，治療便祕可以結合調理腸道菌群的藥物。一般偶爾一兩次便祕可吃些香蕉、水果、酸奶、多喝水。
綜上所述，治療便祕因人而異，因病情不同而有所不同。一些瀉藥不可輕易使用，以免對腸道造成第二次的損傷。
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