慢性牙周炎治療的終極目標是徹底清除牙菌斑、牙石等刺激物，有效消除牙齦炎症，使牙周袋變淺和改善牙周附著水平，爭取牙組織再生。主要是控制菌斑、牙周基礎治療、手術治療、改善咀嚼功能。
1、控制菌斑：儘量使有菌斑的牙面只佔全面牙面的20%以下。
2、牙周基礎治療：潔治術清除牙齦上牙石，刮治術徹底清除齦下牙石，這兩種治療術是牙周病的基礎治療。根面平整術刮除病變牙骨質，使根面平整光滑，有利於牙周附著組織重新附著。
3、手術治療：基礎治療1-2個月後複查效果，若仍殘留大於等於5mm的牙周袋且探診出血，或遇到難以清除的牙石時可採用手術治療慢性牙周炎。
4、改善咀嚼功能：通過鬆動牙的結紮固定、調整等建立平衡的咬合關係，使患牙消除咬合創傷而變得穩固，改善咀嚼功能。
定期的牙周支援治療、複查，是慢性牙周炎的治療關鍵條件之一。堅持菌斑控制，定期複查，預防復發。
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