胸部CT能早期發現病灶，並結合CT影像特徵，診斷可能的疾病，可診斷早期肺部腫瘤，定位診斷病灶所在的肺段，肺葉與中心支氣管的關係，有利於進一步檢查，對於周圍性病變可採取肺穿刺檢查，對於中心性病變可行支氣管鏡檢查，或對於可以手術的患者行術前評估及確診等。
對於非腫瘤性病變，可鑑別診斷間質性肺病，肺部感染，間質性疾病主要以累及間質的網格狀表現，或累及肺泡的滲出樣實變，以胸膜下或支氣管周圍實質改變為主，非肺段或肺葉改變。肺部感染，以大葉性或小葉性實變為主要表現，是否伴有胸腔積液，是否伴有空洞，是否有樹芽樣改變，是否有支氣管擴張樣改變等，對可能的致病菌進行評估，對病情的發展變化進行評估，對疾病的治療反應及預後進行評估等。
對中心氣道疾病進行鑑別，中心氣道病變如氣道狹窄，氣道異物，氣道腫瘤通過氣道三維重建，可以非常直觀的發現病變部位，為進一步治療提供依據。
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