舌下囊腫通常無法自愈，患者應首選手術治療，即將囊腫以及相關腺體一併摘除，基本可達根治效果，可有效預防復發。
舌下囊腫可能為舌下腺囊腫，舌下腺是分泌唾液的腺體，如果舌下腺導管阻塞，分泌的唾液無法正常排出，則會形成舌下腺囊腫。舌下腺囊腫不屬於腫瘤，只是唾液淤積形成的區域性腫脹。囊腫較大時會影響患者進食，通常無法自愈，需通過手術將囊腫和舌下腺一併摘除。舌下囊腫也有可能是舌腹部的一些小囊腫，通常是黏液腺來源，具有分泌唾液的功能，位於口腔黏膜上。如果其開口阻塞，可形成黏液腺囊腫，需進行手術切除。
舌下囊腫患者在手術治療後，要保持口腔乾淨，可以用淡鹽水漱口，恢復期以清淡飲食為主，不要吃辛辣、刺激的食物。
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