治療幽門螺桿菌第一次沒殺死，不需要間隔時間，可以在醫生指導下直接進行第二次治療，如果第二次依然沒有殺死，第三次治療建議間隔3個月以上。
目前對於幽門螺桿菌的治療，只要患者不存在明確臨床禁忌，通常是選擇根治方案。目前提倡四聯方案，即1種PPI、2種抗生素和1種鉍劑，患者可以在醫生指導下選擇敏感藥物，積極治療2周，停止治療後，可在4周以後複查C13呼氣試驗，明確有無根除。另外，由於幽門螺桿菌可通過消化道進行傳播，因此建議分餐制飲食，養成良好的就餐習慣。
在治療期間，前後各1周不能飲酒，建議患者保持清淡飲食，少食油膩、辛辣刺激性的食物，多吃蔬菜水果。
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