脂肪肝與原發性肝癌並無直接關係，但長時間脂肪肝可增加癌變機率，具體肝臟癌變時間無法明確。絕大多數患者積極治療後，預後良好，不會發生癌變。
脂肪肝和肝癌屬於兩種不同疾病，但有一定的關聯性，脂肪肝的發病原因，如過度飲酒，也屬於肝癌重要發病原，我國肝硬化肝癌的病因中，酒精是僅次於乙肝的第二位病因。因此，脂肪肝某種程度上，推動了肝癌的發生。通常單純脂肪肝癌變概率較低，一般1％-2％左右。但如果長期脂肪肝控制不佳，將逐漸發展為脂肪性肝硬化，癌變概率明顯增加，可能達20％左右。因此，患者發現脂肪肝後，需給予早期干預，積極控制不良因素，多數早期輕度脂肪肝可得到逆轉、治癒。
脂肪肝良性疾病患者，日常生活中需注意飲食和運動管理，病情可得到明顯改善。
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