若為單純雙腎囊腫，通常不影響患者壽命；但雙腎多發囊腫，如為先天基因染色體遺傳性病變，晚期可能導致出現腎功能衰竭，可能影響患者壽命，具體存活時間因人而異。
雙腎囊腫屬於良性病變，如果囊腫體積較小，對身體健康影響較小，患者壽命與正常人相同。如果雙腎囊腫<4cm，一般不做任何處理，定期觀察即可。但部分成人雙腎病變，呈多囊腎改變，屬於遺傳性疾病，常於30-50歲後逐漸發病。一旦發病，不接受中西醫有效治療，則可能進展較快，可出現腎衰尿毒症。若進入尿毒症期，治療不積極，患者可於數月內死亡。
雙腎囊腫患者建議飲食宜清淡，減少蛋白質、鹽類、脂肪攝入量，忌食辛辣油膩食物，多進食水果蔬菜，避免劇烈運動和過度勞累。
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