顱骨缺損的危害比較大，顱骨缺損會產生大量的後遺症，這個與損傷的程度有關，症狀也因人而異。損傷程度較輕者，表現為頭痛、焦慮、抑鬱、頭暈、心慌、胸悶、食慾減退、睡眠障礙或者神經功能紊亂等。損傷嚴重者後遺症較多，比如肢體功能癱瘓、大小便失禁、記憶力障礙、痴呆等。因此一定要及時進行手術治療。
然而,並非所有顱骨缺損患者均適宜早期手術，應該嚴格遵循其手術適應證及禁忌證的選擇原則：
1、顱骨缺損面積>3cm者。
2、意識清楚、無併發症者。
3、意識清楚、存在一定併發症,但不影響手術者，如合併偏癱、失語等。
4、早期合併腦積水患者，在條件允許的情況下，儘可能與腦室-腹腔分流術同時完成。
5、開放性損傷或汙染嚴重的粉碎性骨折遺留的顱骨缺損，儘管術中處理十分徹底,亦不主張早期手術。
6、切口癒合差或發生感染者為絕對禁忌證。
現在醫學上採用多的顱骨修補材料是peek（聚醚醚酮）材料。Peek材料是目前先進的治療顱骨缺損的材料。同時也是適合選做顱骨修補手術的材料之一。聚醚醚酮是一種與人體自身顱骨相當的高分子材料。生物相容性更高。它雖然堅固但是很有彈性和韌性，抗擊能力更強，防護效能更好。舒適度也更高。具有很強的隔熱效能。不會有冷熱反應敏感的情況發生。術後也不會出現感染，不會有排斥反應。射線可透過，不形成偽影。
更重要的一點是聚醚醚酮是一種可以三維塑性的材料，可以根據患者的不同需求進行三維重建定製。根據患者的腦部CT資料進行設計，利用3D列印技術製作出與骨窗完美匹配的顱骨修補後的顱骨和自身顱骨基本無異。不過目前來說以peek做顱骨修復的醫院並不多。它對是對國內從事做peek顱骨的醫生技術和專業性也會有較高的要求。所以如有患者需要對此進行治療，還是建議選擇更加專業的醫院。
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