兒童斜視的發病原因不同，型別不同，治療方法也不一樣。
1、根據兒童斜視程度採用不同的治療方法
（1）隱斜視的治療
一般兒童融合和輻輳能力均較強，雖有隱斜，多無症狀，可不做任何治療。有的患隱斜的兒童看書、寫字近距離工作後有眼脹痛、眼眶痠痛，甚至伴有頭痛等視力疲勞等症狀，這樣的應做適當治療。內隱斜可先散瞳驗光，有遠視眼者，配戴合適遠視眼鏡，尤其看近時，需要戴鏡矯正。外隱斜可自行做筆尖輻輳訓練，方法是拿一筆尖放於眼前30釐米處，雙眼盯住筆尖，將筆尖逐漸靠近眼前，這時雙眼球加強輻輳而向內轉，繼續將筆尖移向雙眼，直到雙眼出現復像為止，如此反覆進行多次，這樣的訓練每次堅持5-10分鐘，每日1-3次，以加強雙眼內轉肌的力量來克服外隱斜，如果這樣效果不理想的，對看近大於10單位的外隱斜，可考慮手術治療。
（2）間歇性斜視的治療
間歇性內斜視多為遠視引起，一旦發現應立即帶孩子到醫院做散瞳驗光檢查。醫生按照檢查的遠視度數，配足量遠視眼鏡矯正，戴鏡後多能使間歇性內斜完全正位，不發展成顯性內斜。
間歇性外斜的兒童應首先做斜視度測定和同視機檢查，瞭解外斜程度和雙眼視功能情況，在雙眼視功能未丟失之前儘早手術治療。如雙眼視功能喪失，在7歲前手術矯正仍有恢復正常的可能。對斜視度數很小的可試行戴近視眼鏡及筆尖輻輳訓練，但這隻能減輕斜視，不易完全治癒。
（3）顯性斜視的治療
除調節性內斜視以外多需早期手術治療。
2、根據不同斜視病因採用不同治療方法
（1）共同性斜視的治療
顯性內斜視的治療
先天性內斜視多與眼的調節無關，但對雙眼視功能的發育影響很大，戴眼鏡等非手術治療無法矯正，最好的治療爭取在2歲視功能發育初期做手術矯正。2-3歲以後發生的內斜多與遠視眼引起的調節輻輳過度有關，這種斜視要充分散瞳驗光，有遠視眼的配戴足量遠視眼鏡，堅持戴鐿3個月~半年，斜視完全矯正的繼續戴鏡，部分矯正的，對於殘存的那部分內斜視再手術治療。戴鏡後內斜無改變的，只有手術治療。
顯性外斜視的治療
這類患兒先做視力測定，如雙眼視力均好，可排除明顯的屈光不正，這種斜視的治療原則也是早期手術。視力不良的兒童需散瞳驗光，如果發現為中高度近視，外斜可能由於近視經常不用調節引起，應配戴合適的近視眼鏡，外斜有可能獲得矯正。如果是遠視眼合併弱視眼，應該按矯正最好視力的較低度數配戴遠視眼鏡，同時做弱視訓練，存在的外斜視，仍需手術矯正。
（2）麻痺性斜視的治療
兒童麻痺性斜視多由於先天發育異常，產傷和出生後數月內患病引起。出生後即出現多與發育異常和產傷有關，生後數月內出現的多與疾病有關，應首先尋找病因。醫生除詳細詢問病史外，應請耳鼻喉科、神經內科、腦外科、小兒科會診，排除眼周鼻竇、腦神經和腦內腫瘤等疾病，因為在不少眼周圍和顱內嚴重疾病的早期，可表現為眼外肌的麻痺。這樣可以正確地診斷原發疾病，防止延誤治療機會，避免造成惡果。
治療麻痺性斜視，根據斜視和程度採用不同的方法。
非手術治療
後天性的兒童麻痺性斜視，一經發現，積極尋找病因，針對病因治療的同時，給予注射和口服維生素B
、肌苷、維腦路通、輔酶A、三磷酸腺苷、胞二磷膽鹼等藥物，或按醫囑應用激素和抗菌素，還可做理療，鍼灸等促進麻痺肌肉的恢復。一般需要半年，半年後能自行恢復不考慮手術。
輕度麻痺性斜視的患兒，對於正前方注視沒有斜視及複視，具有雙眼單視，代償頭位也不明顯，只是眼球轉向某一方向時才有複視者，如不影響學習和美容的可不必治療。
手術治療
兒童麻痺性斜視多是先天性的，治療以手術為主。中度麻痺性斜視雖可通過採用一定的代償頭位來克服複視，維持雙眼單視功能的發育，但長久下去可導致臉形、頸部和脊柱畸形，故2-3歲就應做手術矯正，重度斜視更是如此。
由於先天麻痺性斜視雙眼視力都較好，形成弱視的機會不多，雙眼單視功能也往往因為有代償頭位而得到保持，即使雙眼單視功能不健全或全部喪失，只要手術時間早，手術做的恰當，術後眼位得以矯正，代償頭位就會很快消失，雙眼視功能也會很快得以恢復，達到功能性治癒的目的。
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