在丙肝病毒感染的孕婦中，一半以上的人血清HCV RNA陽性。目前認為孕婦HCV RNA水平高低與母嬰傳播有關。HCV RNA陽性孕婦的母嬰傳播率為4.3％。在產後有肝炎發作時進行母乳餵養有可能增加丙肝病毒傳播給嬰兒的危險。
關於母嬰傳播丙型肝炎嬰兒的預後問題，研究表明，3/4母嬰傳播丙型肝炎的兒童在2歲前清除了HCV RNA。若持續陽性則通常被認為可進展到慢性丙型肝炎。是否兒童比成人更容易清除慢性丙肝病毒，以及是否兒童期輸血相關的慢性肝炎和母嬰傳播的慢性丙型肝炎有不同的病程目前尚無定論。
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