腎結石進入輸尿管假如可以自行從輸尿管排出對患者來說是最好的結果，但往往因為結石無法繼續下行而梗阻輸尿管出現腎積水，進而出現腎功能損害。治療輸尿管結石有三種方法：
第一，自發排石，對於較小的結石(直徑小於5mm)，可以通過多飲水，多運動促進結石排出，一般經過一段時間，大部分小結石可以自發排出，假如結石過大，結石寬度大於輸尿管內徑，採用藥物排石就不合適了，此時結石是無法通過輸尿管的;
第二，體外震波碎石，對於直徑大於6mm的結石，由於其直徑大於輸尿管內徑，一般無法自行排出體外，往往需要進行體外震波碎石，將大結石擊成體積較小的結石，利用尿流沖刷作用逐一排出體外。但體外震波碎石也有其禁忌症，比如凝血機制異常患者可能導致出血，心率失常患者體外碎石可能導致心率失常加重。此外反覆體外碎石可以導致輸尿管狹窄或腎萎縮，一定要慎重，因此你體外碎石次數多於2次結石仍然無法破碎，就不適合再進行體外碎石了;
第三，輸尿管鏡，大部分輸尿管結石可以通過輸尿管鏡手術取出體外，尤其對於體外震波碎石無效的患者，大部分可以採用輸尿管鏡手術繼續治療。但輸尿管鏡手術因為是在輸尿管內開展，可能造成輸尿管損傷，施行時要慎重。
第四，經皮腎鏡手術，只適用於腎盂輸尿管連線部位或上段輸尿管內大結石(直徑大於2cm)，此類結石用其他方法或者無效或者效率太低。經皮腎鏡需要在腎臟打眼進行，有一定腎損害。因此適應症不如輸尿管鏡廣泛。
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