正常的牙齒位於牙槽骨上的牙槽窩內。牙槽骨上有牙齦覆蓋，在牙槽骨有牙齦裡分佈著大量的神經血管。拔牙後出現疼痛是由於牙齦及牙槽骨受到創傷所致，一般在拔牙後一天即可消失，而一天後或隔2天出現持續性疼痛，多因為伴有傷口感染。
拔牙後傷口感染多為慢性感染，主要是由於牙槽窩內有異物如碎的牙片、碎骨片、殘根、牙結石及炎性的肉芽組織未及時清除乾淨而引起的。拔牙後最嚴重的感染是幹槽症，此已另外專述。出現上述情況後應及時到醫院就診。這裡要強調說明的是如何預防此類情況的出現。首先在拔牙前要及時清理口腔，如有牙結石可潔除，使口腔較為清潔，以減少誘因。再就是拔牙前可預防性的服用消炎藥，以減少感染的機會。
還有就是牙齒拔除後要按醫生的囑咐半小時左右吐出紗卷，嚴禁漱口，以防凝血塊溶解脫落引起感染。如拔牙後疼痛較明顯，已排除其他原因，可適當服用止痛藥，如止痛片、芬必得等。止痛藥最好只在拔牙當日服用，不可連續多日服用，以避免掩蓋真正的病情。
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