肺部可聞及乾溼囉音及哮鳴音的診斷標準：
肺炎衣原體肺炎 本症臨床表現無特異性，與支原體肺炎楥相似。起病緩，病程長，一般症狀輕，常伴咽、喉炎及鼻竇炎為其特點。上呼吸道感染症狀消退後，出現乾溼?音等支氣管炎、肺炎表現。咳嗽症狀可持續3周以上。白細胞計數正常，胸片無特異性，多為單側下葉浸潤，表現為節段性肺炎，嚴重者呈廣泛雙側肺炎。病原學檢查與沙眼衣原體肺炎一樣，從氣管或鼻咽吸取物做細胞培養，肺炎衣原體陽性。或用熒光結合的肺炎衣原體特異性單克隆抗體來鑑定細胞培養中的肺炎衣原體。PCR檢測肺炎衣原體DNA較培養更敏感，但用咽拭子標本檢測似不夠理想，不如血清學檢測肺炎衣原體特異性抗體。微量免疫熒光(MIF)試驗檢測肺炎衣原體仍最敏感。特異性IgM抗體≥1：16或IgM抗體≥1：512或抗體滴度4倍以上增高，有診斷價值。
輕症可無明顯症狀。青少年常有聲音嘶啞、乾咳、有時發熱、咽痛等咽炎、喉炎、鼻竇炎、中耳炎和支氣管炎等症狀，且可持續數週之久，發生肺炎通常為輕型，與肺炎衣原體感染的臨床表現極為相似，並可能伴隨肺外表現如紅斑結節、甲狀腺炎、腦炎和格林-巴利綜合徵。成年人肺炎多較嚴重，特別是老年人往往必須住院和呼吸支援治療。有作者經血清學調查發現肺炎衣原體感染與冠心病之間有關聯，但尚須進一步確定。另外，肺炎衣原體感染髮生哮喘的機制亦在研討之中。
肺炎衣原體肺炎的肺部X線檢查常顯示肺亞段少量片狀浸潤灶，廣泛實變僅見於病情嚴重者中。大部分患者血白細胞在正常範圍。
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