肝門膽管癌由於位置特殊，在膽管未被腫瘤完全阻塞前常無特異臨床表現，不易引起病人及外科醫生的重視。早期臨床症狀多為納差、食慾下降、厭油膩、消化不良以及上腹脹悶不適等非特異症狀，部分病人可反覆出現膽管感染。隨著病變的進展，可出現阻塞性黃疽的症狀和體徵，但最使病人注意的是進行性黃疽、面板搔癢症和體重下降，這也是HCCA特徵性的臨床徵象。
1、黃疸
膽管癌患者早期缺乏典型症狀，大部分病人多因黃疸而就診，黃疸是膽管癌最早也是最重要的症狀，約有90%～98%的膽管癌病人都有不同程度的面板、鞏膜黃染。黃疸的特點是進行性加重，且多屬無痛性，少數病人黃疸呈波動性。上段膽管癌黃疸出現較早，中、下段膽管癌因有膽囊的緩衝，黃疸可較晚出現。但實際上在黃疽出現之前患者常有一段時間的上腹部飽脹不適、厭油膩、食慾減退、體重下降等非特異性的“胃病”症狀，常因症狀不典型而被誤診為“慢性胃炎”、“慢性膽囊炎”等，有的患者即使出現了黃疽症狀，仍易於被誤診為“黃疽型肝炎”。
2、腹痛
半數左右的患者有右上腹痛脹痛或不適，體重減輕，食慾不振等症狀，這些症狀常被視為膽管癌早期預警症狀。腹痛一開始，有類似膽石症、膽囊炎的疼痛。據臨床觀察，膽管癌發病僅3個月，便可出現腹痛和黃疸。
3、面板瘙癢
可出現在黃疸出現的前或後，也可伴隨有其他症狀如心動過速、出血傾向、精神萎頓、乏力和脂肪瀉、腹脹等，面板瘙癢是因血液中膽紅素含量增高，刺激面板末稍神經而致。
4、其他
伴隨著黃疸、腹痛等症狀，還會有噁心、嘔吐、消瘦、尿色深黃如醬油或濃茶樣，大便色淺黃甚至陶土色等，晚期腫瘤潰破時，出現膽道出血時可有黑便，大便隱血試驗陽性，甚者可出現貧血；若有肝轉移時可出現肝臟腫大，肝硬化等症象。
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