無論是多次人流還是藥流，均會使女性發生異位妊娠的風險增加。人流患者異位妊娠的發生與人流術後感染，人流不全再次清宮或感染性流產有關，流產後引起的異位妊娠主要由於術後併發了生殖器官的炎症，考慮可能為流產過程中陰道流血時間較長或組織殘留於宮腔，或無菌操作不嚴格等均可引起盆腔炎。另外，人流術可引起下丘腦一垂體一卵巢軸功能失調而引起內分泌紊亂，雌、孕激素的協調功能受影響，導致輸卵管的蠕動異常，子宮內膜異位症病灶可以導致盆腔解剖結構的破壞，輸卵管、卵巢周圍的粘連可使輸卵管扭曲，使輸卵管蠕動異常，影響拾卵和受精卵的運送功能。藥物流產後發生異位妊娠的主要原因為輸卵管粘連不暢通，而造成輸卵管通而不暢的主要原因是炎症，藥物流產後出血時間長或組織殘留引起宮腔感染均可引起細菌上行感染導致輸卵管粘連，使輸卵管形成半阻塞狀態。
異位妊娠的發生主要與引起輸卵管異常和影響胚胎輸送的因素密切相關，其中病原微生物所致的盆腔炎性疾病是較常見的原因，引起輸卵管損傷的病原體包括淋病奈瑟菌、沙眼衣原體、以及需氧菌和厭氧菌的混合感染，不同於需氧菌和厭氧菌的是，淋病奈瑟菌和沙眼衣原體感染的症狀並不明顯，甚至早期的處理未必能避免輸卵管的損害，而衣原體常導致嚴重的輸卵管結構和功能的破壞，引起廣泛粘連及瘢痕形成，影響受精卵的正常執行，導致異位妊娠發生風險升高。
國內外諸多研究表明，異位妊娠婦女的輸卵管中PROKR1和PROKR2的表達都會增加。PROKR1是血管內皮生長因子1受體蛋白，可以改變輸卵管內的微環境，促使微環境向有利於胚胎植入的方向發展。增加PROKR1還可以導致輸卵管收縮功能的破壞，通過影響肌肉的調節達到這一點，這樣就降低了輸卵管的活動性，推遲了受精卵進入子宮腔的時間。香菸中尼古丁的代謝產物可替寧可以增加PROKR1的轉錄，從而誘發胚胎在輸卵管部異位種植，發生異位妊娠。
在既往有盆腔手術史的婦女中，如子宮肌瘤剔除術、輸卵管妊娠破裂、卵巢囊腫剝除術等，發生異位妊娠的危險性將增加2倍。這主要與手術後形成的組織粘連會使輸卵管失去其正常的解剖結構，影響輸卵管正常的生理功能。闌尾炎穿孔、闌尾切除術可以造成宮外孕病發的風險增大，這與闌尾炎造成闌尾穿孔後造成闌尾周圍膿腫，或闌尾周圍的炎症累及了右側輸卵管，造成輸卵管的粘連、蠕動障礙，甚至導致輸卵管管腔狹窄，扭曲。這樣就妨礙了受精卵的正常執行，執行受阻，從而導致異位種植。
複方口服避孕藥對衣原體所致的盆腔炎有保護作用，可減輕盆腔炎的嚴重程度，可有效地減少異位妊娠的發生。不過前提一定是要規律使用。不規律使用口服避孕藥是會後患無窮的，若不堅持規律服用，避孕藥中雌-孕激素比例的輕微改變可導致輸卵管功能的失調，影響輸卵管蠕動，推遲卵細胞進入子宮，從而導致受精卵異位種植而增加異位妊娠發生的機會。所以，避孕藥一定要按說明吃哦，千萬不要始亂終棄，不然不僅徒勞無功，還會讓宮外孕“賴”上你。
青少年心理不成熟，性生活過早，性伴侶不固定，又缺乏正確的性生活知識和避孕措施的指導，導致次數不等的人工流產史、中期妊娠引產和藥物流產史。不同程度和不同病原體所導致的盆腔感染史，使輸卵管通而不暢，這使未婚異位妊娠成為可能，再加上婚前性行為者時過度的緊張、焦慮，通過心理影響生理，很容易發生輸卵管痙攣，從而導致異位妊娠的高發生率。有研究發現，經期同房和>1個性伴侶是異位妊娠的危險因素。15歲前開始性生活的青少年盆腔炎的發生率顯著增加，結果導致異位妊娠、慢性盆腔痛和輸卵管不孕的風險增加。
放置宮內節育器後，由於異物反應引起宮內產生非細菌性炎症反應，子宮內膜白細胞及巨噬細胞大量聚集，改變了宮內環境，妨礙了孕卵著床。同時，白細胞和巨噬細胞雖能吞噬精子而減少受孕機會，但不能完全阻止卵子在輸卵管內的受精和著床。因此，帶節育環者一旦妊娠，則異位妊娠的機會相對增加。有研究顯示宮內節育器本身可以是異位妊娠的病因學因素，可以通過輸卵管炎症而起作用。宮內節育器的使用與卵巢妊娠的關係密切，這主要是因為宮內節育器可以刺激子宮內膜分泌大量前列腺素，引起子宮收縮，從而防止宮內妊娠，而卵巢不受影響。
隨著輔助生殖技術的不斷髮展，不孕症患者通過其獲得妊娠的成功率越來越高，從理論上分析， 在體外受精-胚胎移植過程中，胚胎直接植入宮腔內，不通過輸卵管，異位妊娠的發生率應該降低，然而全球通過體外受精-胚胎移植術獲得的第1例妊娠即為宮外孕。輸卵管因素不孕是體外受精-胚胎移植後異位妊娠的主要危險因素。在體外受精-胚胎移植過程中，胚胎雖然置入宮腔內，但著床需要3-5 d，在此期間，胚胎可能會漂游到輸卵管內。輸卵管性因素導致異位妊娠發生的可能機制為：
1、輸卵管黏膜炎症時可使黏膜皺褶粘連、管腔增粗、上皮受損、纖毛脫落、疤痕攣縮、管腔僵硬、變窄、管壁蠕動受限，從而導致遊入輸卵管內的胚胎執行受阻而停留於輸卵管內發育；
2、輸卵管積水可使輸卵管增粗， 使胚胎更容易遊入輸卵管內， 同時積水中某些蛋白質成分利於胚胎的生長髮育， 輸卵管積水逆流入宮腔，導致胚胎宮腔內著床失敗。另外，胚胎移植時刺激子宮引起子宮收縮以及子宮內膜的蠕動， 亦可能將植入宮腔內的胚胎擠壓進入輸卵管內。
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