與西醫比較來看，祖國醫學在治療疣病上具有不可比擬的優勢。西醫主要採用冷凍、鐳射、抗癌藥、腐蝕性藥、區域性封閉免疫增強劑等方法治療，具有創傷大、疼痛劇烈、創面恢復慢、愈後留疤痕等特點；而且，由於治療的深度與寬度不夠或界線不好掌握，從而易造成疣病復發，且治療後的創面極易引起病毒的擴散，從而造成越治越厲害的嚴重後果。特別對兒童、孕產婦、身體虛弱、意志薄弱者容易造成身體與精神的雙重摧殘。
中藥治療疣病主要有兩種方法：
第一種是採用毒性、腐蝕性的藥物。如鬼臼毒素、鴉膽子、狼毒等製劑，通過藥物的毒性及腐蝕性殺滅病毒，使疣體迅速脫落從而達到治療的目的，但這種方法極易出現疣體周圍潰瘍、疼痛，且對亞臨床感染無效，容易出現復發。
第二種辦法是採用溫和的中藥製劑治療。這種製劑沒有毒性與腐蝕性，不能殺滅病毒，但能依靠中藥的有效成分啟用面板和粘膜的免疫活性，增強區域性面板的免疫力，抑制病毒複製，而原有病毒自然凋亡，疣體會越來越小，直至消失，繼續使用可使病毒載量迅速下降，疣體區域性免疫力進一步回升，進而清除殘留病毒，從而達到治療和預防復發的目的。
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