腎結石的微創手術都是通過植入腔鏡（例如腎鏡，輸尿管鏡，腹腔鏡）來建立人工通道，取出結石或者利用鐳射將結石碎石，然後依靠患者自行排出體外。腎結石的微創手術目前比較多用的有兩種手術方式：一種是輸尿管軟鏡鐳射碎石手術；另外一種是經皮腎鏡碎石手術。
經皮腎鏡手術：經皮腎鏡碎石取石術在X線或超聲定位下，經面板、皮下組織到腎皮質，建立穿刺通道，再沿穿刺通道逐步擴張，獲得人工的手術通道，在腎臟上開一個約1釐米左右的創口來尋找結石，最終利用超聲、鐳射、氣壓彈道粉碎結石，在腎鏡下取石或術後依靠患者自行排出體外。
輸尿管軟鏡手術：是通過人的自然通道，也就是尿道，通過導絲的引導和鏡鞘的引導，將輸尿管軟鏡逆行置入腎盂裡，同時探查各個腎小盞尋找結石，用鐳射將結石擊碎，後面靠患者自己排石。
這兩種手術方式各有利弊。由於微創手術損傷小、恢復快、住院時間短，現在越來越得到臨床的廣泛應用。
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