尖銳溼疣的直接病因是人乳頭瘤病毒感染，人乳頭瘤病毒有多種亞型，其中HPV-6、11、16、18型與尖銳溼疣的發病密切相關，同時和所有傳染性疾病一樣，尖銳溼疣的傳播也有傳染源、傳播途徑、易感人群這三個關鍵性要素。
尖銳溼疣的傳染源主要是尖銳溼疣患者，患者發病部位的疣體表面含有大量的病毒包涵體，其傳染性最強。同時，由於感染HPV至出現肉眼可見的皮損有長達1-8月不等的潛伏期，此類亞臨床感染和潛伏感染者，由於無自覺症狀，隱匿性最強，是不可忽視的重要傳染源。
傳播途徑方面，由於HPV病毒易侵襲男女外生殖器及肛周的面板粘膜溼潤區域，所以性接觸是尖銳溼疣的主要傳播途徑。同時，除直接接觸外，一些間接接觸也可以導致病毒傳播，此類情況主要見於和患者有長期共同生活史，並有共用寢具、洗浴用品等生活用品者。此外，患有尖銳溼疣的孕婦可因產道分娩導致新生兒HPV感染。
易感人群方面，尖銳溼疣以性活躍的中青年為高發人群，但近年來，有呈現出老齡化和低齡化兩級發展的趨勢。同時有各種慢性系統性疾病、長期應用免疫抑制藥物、長期酗酒等導致免疫功能低下誘因的人群更易感染和發病。
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