結腸炎是一種結腸黏膜的炎性反應。由於結腸黏膜因炎症液體滲出增加，且結腸黏膜正常的會吸收水分的能力減弱，所以糞便常很有過多的水分，也就是說會出現腹瀉。炎症滲出較多黏液，所以會出現黏液便。炎症導致的糜爛和潰瘍會丟失血液，所以會有血便，若炎症累及了較大的血管，就會出現便血。，腹瀉是結腸炎最多見的臨床症狀。從稀水便，粘液便，膿血便，到血便，因黏膜病變的程度不同，分辨的性狀各不相同。次數也不盡相同。每日1次到數十次不等。
結腸炎常見的症狀還包括，不同程度的腹痛，一般發生在下腹部，特別常見於左側下腹部，疼痛可隨著排便可以自行消失，遇冷或者進食油膩不易消化以及本人不耐受的飲食後疼痛會加重。也會受情緒波動，勞累等因素的影響而加重；其他的症狀還包括腹脹；直腸炎症明顯的患者會有裡急後重，便急，便頻。炎症急性期會有發熱，長期慢性腹瀉會有消瘦和營養不良。便血明顯者會出現貧血。腹瀉嚴重，便血，或伴有貧血，發熱等症狀者需作進一步檢查包括腸鏡等，以明確診斷。
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