自體脂肪隆胸的危害主要包括：術後出現疼痛感，主要是由於脂肪的用量過多或者胸部注射的脂肪太過集中，繼而出現疼痛以及產生囊腫、纖維化或者鈣化、乳房變形、脂肪壞死等；脂肪吸收不均勻，從而造成區域性凹陷或者兩側乳房不均勻的現象；胸部注射脂肪時傷及乳房的毛細血管，或者因為手術者凝血機制障礙，術後的加壓包紮不當所引起出血的狀況。
另外，因術中消毒不嚴格，吸脂、沖洗脂肪或注入脂肪時有汙染，沖洗脂肪時沒有用藥品處理，或供區、受區等部位區域性本身原有慢性炎症在術前未發現，並沒有治療引起術後出現感染狀況；因注入失活的脂肪細胞過多，或注入脂肪不均勻，同一層次、同一部位脂肪注入過多，脂肪未能與移植床廣泛接觸而自行聚整合塊，造成自體脂肪隆胸後出現脂肪液化。
此外，可能因注射不均勻或同一部位注入過多造成脂肪顆粒聚整合塊，受區注射的脂肪向中心聚集，使疏鬆的脂肪組織體積縮小，被乳腺纖維組織包裹成球狀，或術後沒有適當按摩、塑形，未使聚集的脂肪散開，術後加壓包紮不當，或脂肪細胞失活、鈣化等導致出現纖維結節。
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