抽動障礙的治療主要包括心理和藥物兩個方面。
緊張、焦慮、父母等人的過分關注會使抽動症狀更為突出。因此，首先減少患兒焦慮、緊張的情緒。由於抽動症狀並非孩子有意所為，所以不要對孩子的抽動症狀表示過分關注，以免孩子緊張不安，更不應責罵或懲罰孩子，還應向孩子說明疾病的性質及可治癒性，以消除孩子的顧慮。可引導孩子從事一些孩子感興趣的文體活動，如練字、繪畫、打球等，鼓勵孩子與其它孩子一起玩，以轉移注意力，減輕抽動症狀。
並非每個患抽動在障礙的患兒都需要藥物治療，抽動程度輕的、對學習生活沒有明顯影響的抽動障礙不需要藥物治療;目前還沒有證據表明藥物能夠縮短抽動障礙的自然病程。對於程度較重的抽動障礙，可採用藥物治療。目前臨床上控制抽動症狀的常用藥物主要有氟哌啶醇、泰必利、哌迷清、可樂定、利培酮、阿立哌唑等。但這些藥物對抽動症狀只有控制作用，並不能根治本病。對一些伴有反覆呼吸道感染或常因感染而加重或誘發抽動，懷疑有免疫功能紊亂的患兒，加用免疫調節劑如α-干擾素治療，可明顯提高上述藥物的療效。對抽動嚴重而上述藥物的療效不滿意的患兒，可試加用丙戊酸、託吡酯、氯硝西泮等藥物治療。由於治療抽動障礙的藥物常可導致副反應，因此藥物治療的一個基本原則是劑量個體化，小劑量起始，然後緩慢逐漸地增加，並時刻注意可能發生的藥物副反應。
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