如果是良性的囊腫，且較小，一般是不會對胎兒有影響的。可以繼續妊娠。待產後再觀察。因為有一種妊娠後的囊腫是功能性的，伴隨著受孕而產生，隨著分娩而消失。所以要產後再觀察，如不消退，且有增大的傾向，則可考慮手術摘除。卵巢囊腫影響生育嗎，在妊娠期間，有些囊腫可能會破裂，扭轉，會有較劇烈的腹疼，此時應及時就醫診治。
如果囊腫尤其是月經乾淨後複查在5釐米以上，建議病人先明確囊腫是良性還是惡性，最好懷孕前把囊腫去除。不然的話，懷孕前不搞清楚它的性質，假如是惡性的對將來的健康是不利的。即使良性的囊腫，體積比較大，懷孕期間可能會發生破裂等，造成妊娠期急腹症的問題。病人還是在懷孕前把卵巢囊腫的性質、大小、需不需要手術檢查清楚。
有些卵巢囊腫患者在早孕時可能引起流產，中期妊娠時則易發生卵巢囊腫蒂扭轉 ，晚期妊娠囊腫較大者可導致胎位異常 ，分娩時可能阻塞產道引起難產。妊娠期盆腔充血，可使腫瘤迅速增大甚至有引起惡變的可能，因而孕前手術比妊娠手術更有好處。如果已懷孕，在妊娠 16- 24周時手術是合適的。
卵巢囊腫影響生育嗎，手術本身並不影響胎兒的發育，但妊娠12周內手術易引起流產 ，晚期妊娠時手術則比較困難且容易引起早產。當然 ，出現緊急情況如囊腫蒂扭轉或破裂則另當別論，應隨時手術治療。
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