有各種消化道症狀卻沒有有意義的器質性發現,這樣的病人已經佔了消化科門診量的50-60％,這就是所謂胃腸功能紊亂。該組疾病雖不危及生命，但嚴重影響患者的工作和生活質量。近年的研究發現社會心理因素在FGIDs的發病與治療中的作用越來越明顯。目前的治療基本侷限於生物醫學方面治療，收效甚微。
這不僅造成醫療資源極大浪費，而且給患者帶來很大的經濟與精神負擔。由於多種原因,心理治療在國內還沒有很好開展,尤其在很多綜合性醫院甚至還是空白。在充分排除器質疾病後，有選擇的心理治療對該類疾病有很好的療效。結合在國外的學習和近年的治療實踐,
綜合消化界及精神心理學界的研究成果，目前認為對功能性胃腸疾病採用從胃腸治胃腸的方法效果並不理想，同時從腦或從“心”治胃治腸往往更為有效。
目前認為對胃腸功能紊亂有效的心理療法包括：
1)普通心理支援治療
2)認知治療
3)放鬆治療
4)精神動力治療
5)森田療法
6)精神分析和催眠療法。其中普通心理支援治療，認知治療，精神動力治療和森田療法對東方文化背景的患者最為有效。而放鬆治療及流行西方的精神分析和催眠療法對我國患者的效果不如前幾種。森田療法已經包含了精神動力治療，所以，主要介紹普通心理支援治療，認知治療和森田療法。
(1)普通心理支援治療
建立起良好的治療關係是所有其他治療的基礎，而心理支援治療是建立信任關係的第一步。該療法的關鍵技巧是共情作用(empathy)。共情作用是由人本主義創始人羅傑斯(Rogers)首先提出，他認為良好的諮詢本身就具有很好的治療功能。其核心是要讓患者感到自己被理解和接納。
表達共情要做到以患者為中心，滿足個體化需求。要達到準確的共情，有三個要素，
第一、要有共情意識，
第二、要有共情技巧，即懂得有效地實施共情，
第三、要有敏銳的判斷力，對共情的效果隨時要有準確的認識。共情的步驟：
第一、醫生要放下自己的參照標準，保持開放的態度，設身處地去了解患者的不適與痛苦，而不是過多地主觀臆測，與患者達到共鳴。其次表達對患者內心體驗的理解，讓患者明白你已經準確的瞭解了其病痛的內容。最後，要讓患者感受共情的同時，對自身感受做進一步思考。要注意幾個問題：
(1)認真聽，避免倉促應答。倉促應答會經常打斷患者的思路，影響傾訴效果，同時也會使自己沒有足夠的時間去思考患者的話語。
(2)避免一言不發或簡單判斷。
(3)醫生要避免陳詞濫調和一些冠冕堂皇的術語或安慰，還要避免自己的不恰當的身體語言，以免患者產生被打發的感覺。
(2)認知治療
也叫認知行為治療(cognitive-behavior)其操作性很強，原理簡單但操作好很難。特別要求醫生有很強的語言表達能力。通過一些淺顯易懂的比喻來讓患者明白自己的狀況，幫助患者糾正原來的偏見，改變原來的一些思維方法和行為，包括對腫瘤的恐懼，飲食方面的過分小心，對排便時間和次數的苛求，自我體檢自我診病行為以及對人體很多生理現象的錯誤解釋。
要注意，患者的思維或理解雖然是錯誤的但往往並不荒謬。所以，想糾正往往是不容易的。要避免對患者的簡單批評和強行糾正，在交流過程中找準機會糾正其錯誤，否則會導致治療無法繼續。
(3)森田療法
在本世界20年代，佛洛伊德在歐洲創立了精神分析療法，但這種心理療法是以西方文化背景為基礎的。同時代日本的森田正馬醫生創立了東方文化為背景的心理療法，他的弟子們在先生故去後將其稱為森田療法。該療法對胃腸功能紊亂患者，尤其是帶有疑病素質的胃腸功能性疾病患者效果最佳。
解剖這些患者的心理有以下幾方面特徵
(1)疑病恐懼，
(2)對胃腸道的過分關注，
(3)對胃腸道生理現象的錯誤解讀
(4)期望徹底消滅胃腸道症狀的念頭揮之不去。這些特徵之間相互聯絡，形成惡性迴圈。森田認為疑病素質是症狀形成的基礎，精神互動作用則是形成的原因。因此森田療法的核心就是
(1)教會患者順應自然，幫助患者認識其痛苦不適的本質，克服疑病素質。
(2)為所當為，打斷精神互動作用，徹底走出胃腸問題的困境。
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