肝膿腫患者常常由於嚴重感染，出現全身性炎症反應，甚至出現其他臟器功能衰竭(如休克，腎功能衰竭，呼吸衰竭等)而需要在重症醫學科監護及治療。治療及器官功能監護往往著重於重要器官如心、肺、肝、腎，而不太關注其他臟器。有的病人治療期間出現視力下降，或者出現視物異常，應及時請眼科進行專科檢查，眼部超聲是必查的。眼內感染輕則視力下降，重則失明。發現眼內感染應儘早行手術處理。
不但眼內感染，一個部位肝膿腫也可在肝臟其他部位形成膿腫，也有出現心肌膿腫者。曾有患者在肝膿腫好轉後出現猝死，結果屍檢結果竟然是心肌膿腫。
肝膿腫患者之所以出現遠隔部位感染，與肝臟血運豐富，感染菌沿血流“種植”在其他部位有關。
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