查體時發現谷丙轉氨酶升高首先考慮有肝臟疾病，但具體是何種肝臟疾病還需要進一步明確，有些時候肝臟疾病的病因是比較容易發現的，如病毒感染，酒精性肝損傷，經常通過詢問病史以及常規的檢查就可以明確了。
還有一些肝臟疾病診斷是比較困難的，如自身免疫性肝病，代謝性肝病等，常常需要肝穿刺活檢以及一些特殊的檢查才能確診。隨著抗病毒藥物和乙肝疫苗的廣泛應用，乙型肝炎引起的肝臟轉氨酶升高呈下降趨勢，而其它肝臟疾病，如酒精或代謝因素引起的脂肪肝，自身免疫性肝病呈上升趨勢。
病因學的診斷也是診斷的重要組成部分，因為只有針對病因治療才能真正的長期保持健康。
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