兒童單純性肥胖症的治療是一個漫長的過程，由於小兒正處於機體生長髮育的階段，因此，禁止使用減肥藥物、外科手術治療及蒸氣浴、震盪等物理治療，也不提倡短期快速減肥，而是要從飲食、運動、心理等方面入手，既有利於兒童的生長髮育，又能有效的控制兒童的體重增長。
1、制定干預治療計劃 根據評估的結果對輕、中、重度肥胖兒童制定相應的干預治療方案。根據家庭條件、學校情況、兒童的不同飲食習慣和愛好制定飲食方案、運動處方、行為矯治方案等綜合干預治療計劃，讓家長與老師參與，並每月由家長向醫生反饋治療情況，並及時調整和糾正偏差。
2、飲食調節 根據各年齡段生長髮育的特點制定飲食方案，個體化制訂患兒的總熱能和三大營養素的攝入量。膳食調整的原則是低能量下的均衡膳食，即在低能量攝入的情況下保證蛋白質、維生素、礦物質等的攝入。一般建議每日攝入熱量：能量一般5歲以下限於2510～3340kJ/d（600～800kcal/d）、5～10 歲3340～4180kJ/d（800～1000kcal/ d）、10～14歲4180～5020kJ /d（1000～1200kcal/d）。輕、中度肥胖取上述治療方案的上限值，重度肥胖取下限值。早、中、晚3餐熱能分別佔總熱能的25％、40％、35％。葷素重量比為1:2，儘量不吃夜宵，減少主食、甜食、油炸食品等高熱量食品，保證魚、瘦肉、牛奶、蛋類、豆腐等高蛋白食物的充足供給，增加蔬菜、水果在膳食結構中的比例。注意事項：①碳水化合物、蛋白質、脂肪所佔總熱量的比例為45：35：20。以碳水化合物為主食、限制糖類。②蛋白質不應少於2g/kg/d，脂肪嚴格限制，尤其是動物脂肪。③定期檢查食物中營養成分，保證維生素和礦物質的供給。④滿足食慾。避免飢餓，選擇體積大、熱量低的食物，如粗米、粗麵、含纖維素的蔬菜（青菜、芹菜、萵筍、蘿蔔等）、水果。進餐以多次少量為宜，3～5餐。⑤熱量的分配應加強早、中兩餐、減少晚餐量。進餐時應先喝湯或少量水，減慢進餐速度，增加咀嚼次數。
飲食的控制要循序漸進、因人而異的原則，開始只要求制止體重的異常增長，待適應了飲食控制後，可進一步使體重逐漸下降，但是當體重 達到僅高於同齡兒童正常體重範圍的 10％左右時，說明飲食控制有效，可在現有飲食的基礎上不嚴格限制食物。
3、行為矯治 許多肥胖兒童均有以下幾種不良習慣：（1）愛吃高熱量食物（如油炸食物、雪糕等）或專吃葷不吃素；（2）吃飯速度過快，餐次過多或有睡前進食習慣；（3）看電視時間長，每天超過2h，並同時吃零食；（4）運動少，愛睡懶覺。以上的不良行為及習慣造成兒童攝入過多而消耗過少，脂肪蓄積導致肥胖，因而需家長督促採用有針對性的行為矯治方法，其目的是：（1）調節飲食結構葷素搭配得當；（2）減慢吃飯速度，要細嚼慢嚥；（3）減少看電視時間和使用電腦時間每天少於1h為宜；（4）控制零食，不吃夜宵；（5）多運動，可根據兒童的愛好選擇運動方式，並培養對體育運動的興趣。
運動訓練 採用與肥胖兒童環境相適宜的有氧運動，如游泳、跑步、快走、爬山、跳繩、爬樓梯、球類等移動身體的運動，分2部分，第1部分在老師的指導下，每天上午做早操或課間操10-20min，下午參加體育運動30-60min，運動強度應心率達120-140次/min為標準；第2部分則是在家長的督促和陪伴下，每天傍晚訓練，30-60min，運動方式自定，運動強度達心率110-130次/min，可分段間歇進行。可變換運動方式，可將遊戲與運動訓練結合起來。採用陽性強化法行為治療，例如給予適當的物質和精神獎勵，鼓勵兒童堅持運動訓練，以保證運動效果。
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