1、盲目治療。需知，多囊卵巢綜合徵不是一種器質性病變，其引起不孕的原因，是因為卵泡成熟障礙而引起的無排卵，但人體本身就是一個能自我調節的組織，是存在一定機率可以自然排卵的，如果患者還比較年輕，就應該首先選擇依靠中藥調理的同時，嘗試保守治療，以實現自然排卵，但是如果持續無排卵需要定期給予孕激素使子宮內膜得到保護。
如果是育齡期的女性有生育的要求，治療的最終目的是要恢復其正常排卵才算治本，所以不管是中醫還是西醫，恢復排卵才是最終有效的治療措施。
2、應用西藥不規範。多囊卵巢綜合徵的治療，臨床上普遍使用克羅米芬等促排卵藥物進行治療，水平高的醫生是以誘導排卵為治療目的，也就是一個月經週期一般有1-2個成熟卵泡，而不是多個成熟卵泡同時發育，後者會造成卵巢過度刺激及多胎妊娠等較多併發症，所以我們現代的醫生應該認為三胎以上妊娠的發生為自己治療的失敗，而不是以之為榮，所以沒有優勢卵泡發育和有較多卵泡發育都屬於醫生治療的失敗。
3、盲目迷信手術。有些患者，迫切想治癒此病症，一上來就要手術，殊不知手術只是權益之計，不是治本之法，手術本身不能根治多囊，而且對人體損失還是存在的，所以建議患者首先採用保守治療，如果長期不愈，可考慮行小卵泡穿刺術以替代傳統的腹腔鏡下卵巢打孔術，前者幾乎沒有什麼創傷，效果尚佳。
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