治療上由於慢性前列腺炎，尤其慢性非細菌性前列腺炎即慢性盆腔疼痛綜合徵的病因和發病機制不明，有眾多治療方法，可以說每個醫院，甚至同一科室不同的醫生採用不同的治療方案，可見慢性前列腺炎的治療難度和多樣性。
由於慢性前列腺炎不足以威脅患者的生命和重要器官功能，並非所有患者均需治療。只有當前列腺炎症狀影響平時生活和工作、生活質量受影響時，雖然沒有明顯的症狀或症狀較輕但精液引數異常或生育能力受影響時，無論症狀的有無及生育能力是否受影響，已明確為細菌性前列腺炎時才需要治療。對於症狀嚴重的慢性前列腺炎的治療目標主要是緩解疼痛、改善排尿症狀和提高生活質量，療效評價以症狀改善為主；如果治療前列腺炎後生育能力及精液引數沒有明顯改善時，要進一步查詢影響生育能力及精液引數的原因。
目前循證醫學支援的治療方法主要有采取a-受體阻滯劑、植物製劑、抗炎鎮痛藥物、抗抑鬱及抗焦慮藥物、M-受體阻滯劑、中醫中藥等二種或幾種藥物治療，配合心理和行為輔導、生活及飲食習慣的改變、前列腺按摩、前列腺理療等綜合治療，如果明確前列腺炎由病原菌引起，同時加用有效的抗生素。
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